在一些国家里，处方药的控制不严，人类能方便地在药房直接购买，这也在很大程度上加剧了抗生素的滥用——一些患者往往会对自己的症状过度担心，从而在没有医嘱的情况下过量或不必要地服用抗生素，甚至有些人根本就没有生病，却也因对身体健康情况疑神疑鬼，而自行吞下抗生素药片。
自从1928年，英国微生物学家亚历山大·弗莱明发明人类所使用的第一种抗生素——盘尼西林（青霉素）后，人类就进入了“抗生素时代”。
曾有人把盘尼西林和磺胺等抗生素的发明和临床应用，称之为“人类文明史上划时代的伟大进步”。这句话丝毫不夸张：在抗生素发明之前，人类对于各类凶险的疾病往往束手无策，很大程度上要仰赖病人本身的体质和抵抗能力。
当青霉素、链霉素等一系列抗生素（通过发酵、合成等工业化手段批量制造的化学制剂）出现后，其杀灭病菌、抑制病菌繁殖的特效，让许多曾叫人胆寒的疾病，如肺结核、梅毒、淋病、鼠疫等，得到了有效的治愈和控制，成批地挽救了患者的生命，抗生素被视作救死扶伤、药到病除的灵丹妙药，成为万众瞩目的科技发明。
在上世纪四五十年代，一剂盘尼西林（青霉素）曾被囤货居奇的投机商炒到近乎等量黄金的价格。但随着抗生素生产门槛的降低，这种疗效又快又好的药剂慢慢的变大众化，如今不仅工业化国家，即便卫生条件滞后的许多不发达国家、地区，在有关国家、国际组织和慈善机构的帮助下，也能基本满足抗生素的需求。
由于相较于其他治疗手法，抗生素效果好，见效快，且价钱也慢慢变得便宜，患者及其家属开始对抗生素产生一种依赖性。随着医保体制在许多国家的推行和完善，医疗部门和医生都希望用最经济、最有效的方法治愈患者，避免宝贵的医疗资源、资金被少数患者长期占用，因此也往往自觉不自觉地加大抗生素用量，或同时并用多种抗生素，以期提高疗效。
在一些国家里，处方药的控制不严，人类能方便地在药房直接购买，这也在很大程度上加剧了抗生素的滥用——一些患者往往会对自己的症状过度担心，从而在没有医嘱的情况下过量或不必要地服用抗生素，甚至有些人根本就没有生病，却也因对身体健康情况疑神疑鬼，而自行吞下抗生素药片。
许多医学家都指出，抗生素仅仅对细菌、真菌等拥有细胞的病菌具有杀灭抑制作用，而对病毒类疾病基本无效，但在现实治疗中，许多患者在患上诸如病毒性感冒等病症时，也会要求医生开抗生素，而许多时候医生也照办不误。
不仅如此，随人类肉、蛋、奶摄入量的增加，和机械化养殖的普及，普遍应用在家畜、家禽饲养中的兽医用抗生素，也开始影响人类的生活和健康。
滥用抗生素最直接的结果，就是病菌抗药性的产生和慢慢地增加。所谓“抗药性”，指病菌对抗生素的杀灭、抑制作用产生抗体，从而令抗生素的效果显著下降、甚至基本消失。
早在2001年，时任世界卫生组织总干事的挪威人布伦特兰夫人，就在专题报道中，精确指出滥用抗生素及由此所致抗生素耐药性的危害。2010年，世卫组织再度发表公告，表示抗药性细菌已日益成为“全球公共问题”，并正影响多种传染病的控制。公报指出，由于抗生素的滥用，许多致病细菌已变异为多药耐药性细菌（即所谓“超级细菌”），对大多数常用抗生素均产生耐药性，令治疗变得十分困难，公报将2011年世界卫生日的主题，定为“抗击耐药性细菌”。
在世卫组织呼吁之初，“超级细菌”尚主要肆虐于南亚、非洲等第三世界国家，在这些国家里，广泛使用的抗生素都是落后一代、两代的过时货，“超级细菌”对这些抗生素产生了很强的抗药性，而在工业化国家，抗生素的不断更新换代，尚足以跟上病菌变异的步伐。
但近年来情况又有了新的变化：2012年英国医学家称，在短短5年不到时间里，英国耐药菌感染已增加了30%，出现了诸如“杀不死的大肠杆菌”等“超级细菌”；更早一些，美国亚利桑那州立大学生物设计研究所主任乔治·鲍斯特就发出警告，称金黄色葡萄球菌等“超级细菌”将在5-10年内突破抗生素最后一道防线年出现令人担心的“抗生素窗口”，也就是说，“超级细菌”的变异速度将超过抗生素研发速度，从而令人们在一段时间里无特效抗生素可用。
这并非危言耸听：2011年7月，德国联邦公众传染病预防与监控主管机构罗伯特·科赫研究所宣布，在德国和荷兰此前突发的肠出血性大肠杆菌疫情，所有27例在两个月内死亡的患者，都是被“超级细菌”夺去了性命。世卫组织总干事陈冯富珍警告，如滥用抗生素的现象得不到扭转，人类很快将进入所谓“后抗生素时代”，届时许多原本极普通的病菌感染类疾病都将无药可用，“细菌将像抗生素发明前那样无法被杀灭”。
世卫组织指出，除了滥用抗生素外，导致耐药性危机爆发和“超级细菌”肆虐的原因是多方面的。
首先，由于抗生素是速效药，且其临床使用受到严格限制，对于医药巨头们而言，开发新抗生素在商业上风险大、利润低，美国抗感染学会2011年一份报告数据显示，上世纪90年代，全球投入抗生素新药开发的药企有近20家，而如今仍在这样做的大型药企，已只剩葛兰素史克和阿斯利康两家。
其次，随网络时代的到来，一些“假抗生素”开始流行。美国食品与药物管理局2013年针对本国1万家网上药店调查发现，97%的抗生素销售都不符合美国食品与药物管理局医药监管标准，而世卫组织在80个国家进行的监测调查表明，抗生素已成为全世界造假最多的药品之一。这些“假抗生素”通常并非完全意义上的假药，而是以次充好，或以淘汰的旧制剂冒充新制剂，因此它们对病菌的杀灭作用有限，却很容易令病菌产生更强的耐药性。
针对“抗生素危机”，世卫组织2010年的公报提出4点要求：严格监测“超级细菌”、合理使用抗生素、引进或执行有关停止无处方销售抗生素的法规，以及严格执行诸如洗手等预防控制措施。
一些科学家指出，由于抗生素产业风险大、投入高、利润低，仅仅依靠商业杠杆很难促进抗生素新药研发，政府一定要采取措施，鼓励药企加大开发力度。2011年，美国通过《抗生素开发激励法案》，宣布美国食品与药物管理局将给与新兴抗生素开发和审批优先权，接受审评申请后6个月内必须启动审评，从而加快其对新抗生素的审批速度，法案还宣布延长新抗生素的专利独占期限，以保护新药开发者的利益。欧盟、加拿大等国也正研讨类似的激励措施。
美欧等国还采用直接资助的方法，鼓励新抗生素的研发。如NM4TB（针对耐药结核病的抗生素新药研究）和ActionGEN（从放线菌中提取新抗生素的项目），前者有来自13个国家的18名科学家一同推动，后者则由9个欧洲国家和韩国的18名科学家共同主持，项目均得到欧盟的官方资助。由此,一些大的医药公司也重新投入到新抗生素开发。
然而这一切的见效都需要一些时间，人们必须努力控制抗生素的滥用现象，为新药的研制争取时间，避免“抗生素窗口”在新抗生素推出前出现。
